בבתי השנטי מרכז חוגים, סדנאות, פעילויות העשרה, טיפולים ושיעורים פרטיים, שנועדו לקלף ולטפל בבני הנוער מבחינה נפשית, לימודית וחברתית. שיטת הטיפול של בית השנטי מחזקת את תחושת השייכות, האחריות והבגרות של בני הנוער ויוצרת אינטגרציה ושוויון בינם לבין עצמם. לשיטת הטיפול תרומה גדולה בשיקום הילדים ובהשבת השמחה לחייהם.